Análisis molecular de Fibrosis Quística: 24 mutaciones

GENERALIDADES

La fibrosis quística (FQ) es la entidad autosómica recesiva más frecuente dado que se observa en uno de cada 2500 recién nacidos, se caracteriza por afectar principalmente vías respiratorias, páncreas, sistema gastrointestinal y sistema reproductivo (este último solo en varones); a la fecha se han descrito más de 1500 mutaciones en el gen responsable de la enfermedad: CFTR, en este estudio molecular se analizan 24 mutaciones en este gen: 12 reportadas en el 69% de la población hispana con FQ y 18 de las 23 mutaciones recomendadas en el panel molecular de identificación de portadores de FQ para la población en general, con lo cual se identifica el 80% de los alelos condicionantes de FQ en población hispana-mexicana. En este estudio se realiza la técnica PCR (reacción en cadena de la polimerasa) y secuenciación Sanger.

 

INDICACIONES

 

1.- Recién nacidos con tamiz neonatal positivo a Fibrosis Quística por presencia de tripsinógeno elevado.

2.- Pacientes con datos clínicos sugestivos de Fibrosis Quística (historia de íleo meconial, insuficiencia pancreática exócrina o infecciones respiratorias recurrente).

3.- Pacientes con diagnóstico confirmado por determinación de cloruros en sudor alterada (>60mEq/l).

4.- Identificación de portadores en padres y hermanos de pacientes en quienes se haya identificado la mutación responsable en el gen CFTR.

5.- Diagnóstico prenatal en familias en donde se haya identificado la mutación responsable.

6.- Varones con azospermia obstructiva (atresia congénita bilateral de vasos deferentes).

MUESTRA REQUERIDA

En pacientes con sospecha o diagnóstico de fibrosis quística:

a) 3-5 ml. de sangre periférica con anticoagulante EDTA (tubo VacutainerÒ tapón lila o de biometría hemática), la muestra se puede conservar en refrigeración a 4ºC (NO CONGELAR), incluso por 5 a 7 días previo a su procesamiento.

b) Muestra de raspado de mucosa: con 2 a 3 cepillos estériles de citología o con un cepillo dental nuevo realizar de 20 a 30 raspados en carrillos y lengua, dejar secar a temperatura ambiente y enviar secos. La muestra se puede conservar a temperatura ambiente por 8 días previo a su procesamiento.

c) Sangre seca colocada en papel filtro (enviar 5 círculos cubriéndolos en su totalidad), enviar a temperatura ambiente.

 

2.- Para diagnóstico prenatal en familias en donde se haya identificado la mutación responsable en el gen CFTR: Líquido amniótico (5ml), la muestra se puede conservar a temperatura ambiente por 3 días previo a su procesamiento.

 

TIEMPO DE ENTREGA                                                    
2 a 3 semanas (diagnóstico prenatal en 5 a 7 días).

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FQ 24 mut

Se muestran las 24 mutaciones identificadas en el panel ampliado de            Fibrosis Quística

 

GQ 24 mut electro

Electroferograma parcial del exón 3 del gen CFTR (cadena “forward”), de acuerdo a las secuencias de referencia del gen CFTR (NM_000492.3 y NG_016465.4), la flecha indica un genotipo heterocigoto para una variante puntual de tipo transición y sin sentido c.223C>T (p.Arg75*), que cambia el sentido del codón 75 de arginina (CGA) por uno de paro prematuro (TGA). El efecto predicho de esta mutación es severo o amorfo (Mutación Clase I de CFTR: síntesis reducida o ausente), al interrumpir la síntesis de una proteína CFTR funcional.

Electroferograma parcial del exón 11 del gen CFTR (cadena “forward”). De acuerdo a las secuencias de referencia del gen CFTR (NM_000492.3 y NG_016465.4), la flecha indica el inicio del corrimiento del electroferograma por el genotipo heterocigoto para la microdeleción de tres pares de bases que mantiene el marco de lectura denominada “delta-F508” (nomenclatura tradicional) o c.1521_1523del o p.(Phe508delPhe) (nomenclatura HGVS), la cual elimina a la fenilalanina 508 de la proteína CFTR.

El estudio confirma el diagnóstico de Fibrosis quística ante un genotipo CFTR heterocigoto compuesto en el paciente c.223C>T/ c.1521_1523del.